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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Nymphaea colorata , Water lily , スイレン

Nymphaea colorata

Genome Assembly ID:t210225.G001

配列名:ASM883128v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM883128v1 系統名 isolate Beijing-Zhang1983
配列数 800 染色体数 2n = 2x = 28
配列長 (bp) 409,013,923 N50長 (bp) 25,516,871
遺伝子の数 33,500 遺伝子数由来ファイル GCF_008831285.1_ASM883128v1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 33,500 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII; Hi-C 取得した配列量 124.0x
アセンブリ方法 CANU v. 1.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 409
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Liangsheng Zhang (Fujian Agriculture and Forestry University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41586-019-1852-5 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:95.3%[S:93.1%,D:2.2%],F:2.4%,M:2.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.6%[S:56.8%,D:40.8%],F:0.3%,M:2.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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