配列名:ASM883128v1
ゲノム配列名 | ASM883128v1 | 系統名 | isolate Beijing-Zhang1983 |
配列数 | 800 | 染色体数 | 2n = 2x = 28 |
配列長 (bp) | 409,013,923 | N50長 (bp) | 25,516,871 |
遺伝子の数 | 33,500 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_008831285.1_ASM883128v1_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 33,500 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio RSII; Hi-C | 取得した配列量 | 124.0x |
アセンブリ方法 | CANU v. 1.3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 409 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Liangsheng Zhang (Fujian Agriculture and Forestry University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41586-019-1852-5 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:95.3%[S:93.1%,D:2.2%],F:2.4%,M:2.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:97.6%[S:56.8%,D:40.8%],F:0.3%,M:2.1%,n:1614 |