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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Corchorus capsularis var. Huangma 179 , Jute, White jute , ツナソ, ジュート, コウマ, カナビキオ (Huangma 179変種)

Corchorus capsularis

Genome Assembly ID:t210143.G002

配列名:GWHBCLC00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBCLC00000000 系統名 var. Huangma 179
配列数 71 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 340,598,260 N50長 (bp) 46,235,593
遺伝子の数 22,192 遺伝子数由来ファイル GWHBCLC00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 22,192 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 120x
アセンブリ方法 CANU 推定ゲノムサイズ (Mb) 348
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Liwu Zhang (Fujian Agriculture and Forestry University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.13652 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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