配列名:PHallii_v3.1
ゲノム配列名 | PHallii_v3.1 | 系統名 | var. filipes genotype FIL2 |
配列数 | 291 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 535,889,049 | N50長 (bp) | 57,869,027 |
遺伝子の数 | 37,612 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_002211085.1_PHallii_v3.1_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PACBIO SEQUEL; Illumina HISeq; MOLECULO | 取得した配列量 | 95.87x(PACBIO), 92.1x(Illumina), 6.9x (MOLECULO) |
アセンブリ方法 | MECAT | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 500 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | John T.Lovell(University of Texas at Austin), Thomas E.Juenger(University of Texas at Austin), Jeremy Schmutz(Genome Sequencing Center, HudsonAlpha Institute for Biotechnology; Department of Energy Joint Genome Institute) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-018-07669-x | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.2%[S:96.4%,D:1.8%],F:0.9%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.5%[S:66.5%,D:33.0%],F:0.2%,M:0.3%,n:1614 |