Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Panicum hallii var. filipes , Hall's panicgrass (var. filipes) , パニックグラス (filipes変種)

Panicum hallii

Genome Assembly ID:t206008.G001

配列名:PHallii_v3.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PHallii_v3.1 系統名 var. filipes genotype FIL2
配列数 291 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 535,889,049 N50長 (bp) 57,869,027
遺伝子の数 37,612 遺伝子数由来ファイル GCF_002211085.1_PHallii_v3.1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PACBIO SEQUEL; Illumina HISeq; MOLECULO 取得した配列量 95.87x(PACBIO), 92.1x(Illumina), 6.9x (MOLECULO)
アセンブリ方法 MECAT 推定ゲノムサイズ (Mb) 500
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 John T.Lovell(University of Texas at Austin), Thomas E.Juenger(University of Texas at Austin), Jeremy Schmutz(Genome Sequencing Center, HudsonAlpha Institute for Biotechnology; Department of Energy Joint Genome Institute) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-018-07669-x データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:96.4%,D:1.8%],F:0.9%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.5%[S:66.5%,D:33.0%],F:0.2%,M:0.3%,n:1614

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット