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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ceratotheca triloba , Wild foxglove, Wild sesame , ワイルドフォックスグローブ, 野生ゴマ, ゴマ野生種 (Ceratotheca triloba種)

Ceratotheca triloba

Genome Assembly ID:t192255.G001

配列名:Ctri_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Ctri_v1.0 系統名 PI 365013 (USDA)
配列数 228 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 394,848,371 N50長 (bp) 11,783,658
遺伝子の数 24,615 遺伝子数由来ファイル C.triloba_annotation_v1.0_protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina PE, PacBio CLR 取得した配列量 383x
アセンブリ方法 Canu v2.1.1; Arrow (gcpp 1.0.0-SL-release-8.0.0); Pilon v1.24 推定ゲノムサイズ (Mb) 407
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Masayuki Yamamoto (Toyama University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.4.3 BUSCO データセット eudicots_odb10
BUSCO ゲノム C:98.3%[S:92.5%,D:5.8%],F:0.5%,M:1.2%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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