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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Mikania micrantha , Bitter vine , ツルヒヨドリ

Mikania micrantha

Genome Assembly ID:t192012.G001

配列名:ASM936387v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM936387v1 系統名 isolate NLD-2019
配列数 2,815 染色体数 2n = 2x = 38
配列長 (bp) 1,790,643,622 N50長 (bp) 86,674,320
遺伝子の数 46,329 遺伝子数由来ファイル GCA_009363875.1_ASM936387v1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 46,329 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII; PacBio Sequel 取得した配列量 134.0x
アセンブリ方法 Canu v. 1.6; FALCON v. 1.2.0; FALCON-Unzip v. 1.1.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,860
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A M. micrantha sample, which was collected form Neilingding Island, Shenzhen, China.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Changlian Peng (South China Normal University), Wanqiang Qian (Chinese Academy of Agricultural Sciences), Wei Fan (ditto), anghao Wan (ditto) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-019-13926-4 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.3%[S:68.7%,D:27.6%],F:0.4%,M:3.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:88.6%[S:64.9%,D:23.7%],F:3.8%,M:7.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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