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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gynandropsis gynandra , Spider plant, Spider-flower, African cabbage, Cat's-whiskers, Acaya, Bastard-mustard, Cat's-whiskers, Mouzambi , フウチョウソウ

Gynandropsis gynandra

Genome Assembly ID:t190802.G002

配列名:GWHCBIX00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHCBIX00000000 系統名 NA
配列数 17 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 909,609,864 N50長 (bp) 51,686,688
遺伝子の数 37,310 遺伝子数由来ファイル GWHCBIX00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 180x (ONT), 618x (PacBio), 162x (Hi-C)
アセンブリ方法 CANU v1.7.1, Hifiasm v0.19.4, Juicer v1.6, 3D-DNA 推定ゲノムサイズ (Mb) 998
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jun Liu (Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1093/hr/uhad129 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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