Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gynandropsis gynandra , Spider plant, Spider-flower, African cabbage, Cat's-whiskers, Acaya, Bastard-mustard, Cat's-whiskers, Mouzambi , フウチョウソウ

Gynandropsis gynandra

Genome Assembly ID:t190802.G001

配列名:Gynandropsis_gynandra_616

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Gynandropsis_gynandra_616 系統名 line GYN
配列数 1,241,060 染色体数 2n = 34
配列長 (bp) 1,042,892,128 N50長 (bp) 293,254
遺伝子の数 35,490 遺伝子数由来ファイル Cleome_gynandra.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 10x Genomics, Hi-C 取得した配列量 124.7x (Illumina), 68.4x (10x)
アセンブリ方法 Supernova, ARCS v1.1, 3D-DNA v180922 推定ゲノムサイズ (Mb) 930
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 M Eric Schranz (Wageningen University) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1093/plcell/koad018 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット