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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Rubus corchorifolius , Shanmei or mountain berry , ビロードイチゴ

Rubus corchorifolius

Genome Assembly ID:t190223.G001

配列名:GWHBDNY00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBDNY00000000.genome 系統名 Shanmei
配列数 10 染色体数 2n = 14
配列長 (bp) 215,685,748 N50長 (bp) 29,519,794
遺伝子の数 26,696 遺伝子数由来ファイル GWHBDNY00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Illumina, Hi-C 取得した配列量 180x(Nanopore), 220x(Hi-C)
アセンブリ方法 NextDenovo (version 2.0) 推定ゲノムサイズ (Mb) 188
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shuhua Yang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.gpb.2022.05.003 データソースURL https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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