配列名:Areca_catechu_assembly_v1
ゲノム配列名 | Areca_catechu_assembly_v1 | 系統名 | Reyan No.1 |
配列数 | 4,323 | 染色体数 | 2n = 32 |
配列長 (bp) | 2,513,067,666 | N50長 (bp) | 171,974,900 |
遺伝子の数 | 31,569 | 遺伝子数由来ファイル | Areca_catechu.gene.v1.0.pep.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, Hi-C | 取得した配列量 | 240x(Illumina), 49x(PacBio), 98.8x(Hi-C) |
アセンブリ方法 | Platanus | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,590 |
シーケンシングの方法のコメント | Libraries with insert sizes of 500 bp, 800 bp, 2, 5, 10, 20, and 40 kb(Illumina) | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Weiquan Qin (Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) | データソース名 | China National GeneBank DataBase (CNGBdb) |
論文 (DOIコード) | 10.1111/1755-0998.13446 | データソースURL | https://db.cngb.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |