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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Areca catechu , Betel nut, Areca nut , ビンロウ, ビンロウジ

Areca catechu

Genome Assembly ID:t184783.G001

配列名:Areca_catechu_assembly_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Areca_catechu_assembly_v1 系統名 Reyan No.1
配列数 4,323 染色体数 2n = 32
配列長 (bp) 2,513,067,666 N50長 (bp) 171,974,900
遺伝子の数 31,569 遺伝子数由来ファイル Areca_catechu.gene.v1.0.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 240x(Illumina), 49x(PacBio), 98.8x(Hi-C)
アセンブリ方法 Platanus 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,590
シーケンシングの方法のコメント Libraries with insert sizes of 500 bp, 800 bp, 2, 5, 10, 20, and 40 kb(Illumina) コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Weiquan Qin (Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) データソース名 China National GeneBank DataBase (CNGBdb)
論文 (DOIコード) 10.1111/1755-0998.13446 データソースURL https://db.cngb.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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