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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Collinsia rattanii , Collinsia rattanii , コリンソウ (rattanii種)

Collinsia rattanii

Genome Assembly ID:t183431.G001

配列名:rattanii_manual_breaks_bamfilt.final

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 rattanii_manual_breaks_bamfilt.final 系統名 wild accession
配列数 5,029 染色体数 diploid(n = 7)
配列長 (bp) 506,580,232 N50長 (bp) 69,253,743
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Hi-C 取得した配列量 377x(Illumina), 72x(Hi-C)
アセンブリ方法 HiRise 推定ゲノムサイズ (Mb) 682(Kmer analysis from raw sequence reads), 673(Meraculous assembly)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Rachel Spigler (Temple University) データソース名 figshare
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkab177 データソースURL https://gsajournals.figshare.com/articles/online_resource/Supplemental_Material_for_Frazee_et_al_2021/14599995
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
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