配列名:rattanii_manual_breaks_bamfilt.final
ゲノム配列名 | rattanii_manual_breaks_bamfilt.final | 系統名 | wild accession |
配列数 | 5,029 | 染色体数 | diploid(n = 7) |
配列長 (bp) | 506,580,232 | N50長 (bp) | 69,253,743 |
遺伝子の数 | 0 | 遺伝子数由来ファイル | NA |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, Hi-C | 取得した配列量 | 377x(Illumina), 72x(Hi-C) |
アセンブリ方法 | HiRise | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 682(Kmer analysis from raw sequence reads), 673(Meraculous assembly) |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Rachel Spigler (Temple University) | データソース名 | figshare |
論文 (DOIコード) | 10.1093/g3journal/jkab177 | データソースURL | https://gsajournals.figshare.com/articles/online_resource/Supplemental_Material_for_Frazee_et_al_2021/14599995 |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |