Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cerasus x kanzakura , Early-flowering cherry , カンザクラ

Cerasus x kanzakura

Genome Assembly ID:t1813533.G002

配列名:ATM_r1.0.pmol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ATM_r1.0.pmol 系統名 Atami-zakura
配列数 18 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 509,849,749 N50長 (bp) 32,639,480
遺伝子の数 69,528 遺伝子数由来ファイル ATM_r1.0.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 21x
アセンブリ方法 Canu 推定ゲノムサイズ (Mb) 675
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2021.09.08.459382 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.1%[S:17.6%,D:81.5%],F:0.6%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.6%[S:21.0%,D:74.6%],F:1.4%,M:3.0%,n:1614

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット