配列名:ATM_r1.0.pmol
ゲノム配列名 | ATM_r1.0.pmol | 系統名 | Atami-zakura |
配列数 | 18 | 染色体数 | 2n = 2x = 26 |
配列長 (bp) | 509,849,749 | N50長 (bp) | 32,639,480 |
遺伝子の数 | 69,528 | 遺伝子数由来ファイル | ATM_r1.0.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 69,528 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 21x |
アセンブリ方法 | Canu | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 675 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2021.09.08.459382 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.1%[S:17.6%,D:81.5%],F:0.6%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.6%[S:21.0%,D:74.6%],F:1.4%,M:3.0%,n:1614 |