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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cerasus x kanzakura , Early-flowering cherry , カンザクラ

Cerasus x kanzakura

Genome Assembly ID:t1813533.G001

配列名:KWZ_r1.0.pmol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 KWZ_r1.0.pmol 系統名 Kawazu-zakura
配列数 18 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 519,996,277 N50長 (bp) 33,630,106
遺伝子の数 72,702 遺伝子数由来ファイル KWZ_r1.0.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 72,702 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 52x
アセンブリ方法 Falcon 推定ゲノムサイズ (Mb) 672
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2021.09.08.459382 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:14.0%,D:84.9%],F:0.7%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.7%[S:14.1%,D:81.6%],F:0.9%,M:3.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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