配列名:KWZ_r1.0.pmol
ゲノム配列名 | KWZ_r1.0.pmol | 系統名 | Kawazu-zakura |
配列数 | 18 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 519,996,277 | N50長 (bp) | 33,630,106 |
遺伝子の数 | 72,702 | 遺伝子数由来ファイル | KWZ_r1.0.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 72,702 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 52x |
アセンブリ方法 | Falcon | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 672 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2021.09.08.459382 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.9%[S:14.0%,D:84.9%],F:0.7%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.7%[S:14.1%,D:81.6%],F:0.9%,M:3.4%,n:1614 |