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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gerbera hybrida , Gerbera , ガーベラ

Gerbera hybrida

Genome Assembly ID:t18101.G001

配列名:Ghyb_p1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Ghyb_p1.1 系統名 Opal
配列数 44 染色体数 2n = 2x = 50
配列長 (bp) 2,317,611,010 N50長 (bp) 87,579,574
遺伝子の数 36,281 遺伝子数由来ファイル Ghyb_p1.1.protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio HiFi, Dovtail Omni-C 取得した配列量 107x
アセンブリ方法 Hifiasm v0.19.5, Oatk v1.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,398
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Current name (NCBI Taxonomy): Gerbera hybrid cultivar; Ghyb_p1.1_001.1 ~ Ghyb_p1.1_042.1: Nuclear genome sequences assembled by Hifiasm. Ghyb_p1.1C and Ghyb_p1.1M: Chloroplast and mitochondrial genome sequences assembled by Oatk.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yuta Aoyagi (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2025.08.15.670457 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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