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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chloropicon primus , Green algae , クロロピコン, 緑藻

Chloropicon primus

Genome Assembly ID:t1764295.G001

配列名:ASM785969v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM785969v1 系統名 strain CCMP1205
配列数 20 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 17,400,691 N50長 (bp) 1,089,399
遺伝子の数 8,639 遺伝子数由来ファイル GCA_007859695.1_ASM785969v1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 8,639 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBIO 取得した配列量 391.0x
アセンブリ方法 Celera Assembler v. 8.3RC1; HGAP3 v. SMRT Portal 2.3.0; Ray v. 2.3.2-devel 推定ゲノムサイズ (Mb) 17
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Most Chloropicon chromosomes have a diploid structure
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Claude Lemieux (Universite Laval) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-019-12014-x データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット chlorophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:89.8%[S:88.2%,D:1.6%],F:0.9%,M:9.3%,n:1519 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:91.4%[S:89.6%,D:1.8%],F:0.5%,M:8.1%,n:1519

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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