配列名:ASM785969v1
ゲノム配列名 | ASM785969v1 | 系統名 | strain CCMP1205 |
配列数 | 20 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 17,400,691 | N50長 (bp) | 1,089,399 |
遺伝子の数 | 8,639 | 遺伝子数由来ファイル | GCA_007859695.1_ASM785969v1_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 8,639 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBIO | 取得した配列量 | 391.0x |
アセンブリ方法 | Celera Assembler v. 8.3RC1; HGAP3 v. SMRT Portal 2.3.0; Ray v. 2.3.2-devel | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 17 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Most Chloropicon chromosomes have a diploid structure |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Claude Lemieux (Universite Laval) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-019-12014-x | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | chlorophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:89.8%[S:88.2%,D:1.6%],F:0.9%,M:9.3%,n:1519 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:91.4%[S:89.6%,D:1.8%],F:0.5%,M:8.1%,n:1519 |