配列名:PitayaGenomic
ゲノム配列名 | PitayaGenomic | 系統名 | Guanhuabai |
配列数 | 871 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 1,387,322,347 | N50長 (bp) | 127,145,692 |
遺伝子の数 | 277,350 | 遺伝子数由来ファイル | PitayaGenomic.protein.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina, Hi-C, 10X Genomics | 取得した配列量 | 113.23x(PacBio), 150.62(10x Genomics), 111.90x(Hi-C) |
アセンブリ方法 | FALCON version 0.2.2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,580 |
シーケンシングの方法のコメント | 7 paired-end genome sequencing reads of 250bp to 10kb inserts were processed and loaded onto the Illumina HiSeq x 10 platforms for sequencing. | コメント | Synonym: Hylocereus undatus |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Yong-hua Qin (South China Agricultural University) | データソース名 | Pitaya genome website |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41438-021-00612-0 | データソースURL | http://www.pitayagenomic.com/download.php |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |