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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Selenicereus undatus , Pitaya, Dragon fruit , ドラゴンフルーツ

Selenicereus undatus

Genome Assembly ID:t176265.G002

配列名:PitayaGenomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PitayaGenomic 系統名 Guanhuabai
配列数 871 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 1,387,322,347 N50長 (bp) 127,145,692
遺伝子の数 277,350 遺伝子数由来ファイル PitayaGenomic.protein.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C, 10X Genomics 取得した配列量 113.23x(PacBio), 150.62(10x Genomics), 111.90x(Hi-C)
アセンブリ方法 FALCON version 0.2.2 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,580
シーケンシングの方法のコメント 7 paired-end genome sequencing reads of 250bp to 10kb inserts were processed and loaded onto the Illumina HiSeq x 10 platforms for sequencing. コメント Synonym: Hylocereus undatus
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yong-hua Qin (South China Agricultural University) データソース名 Pitaya genome website
論文 (DOIコード) 10.1038/s41438-021-00612-0 データソースURL http://www.pitayagenomic.com/download.php
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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