Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Andrographis paniculata , Chuanxinlian, Kalmegh , アンドログラフィス

Andrographis paniculata

Genome Assembly ID:t175694.G002

配列名:ASM980555v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM980555v1 系統名 NA
配列数 271 染色体数 NA
配列長 (bp) 284,458,270 N50長 (bp) 5,149,272
遺伝子の数 39,992 遺伝子数由来ファイル GCF_009805555.1_ASM980555v1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel, Hi-C 取得した配列量 183x
アセンブリ方法 HERA, Juicer 推定ゲノムサイズ (Mb) 310
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yang Dong (Guangxi Botanical Garden of Medicinal Plants) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.3389/fgene.2020.00701 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット