Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Draba nivalis , Draba nivalis , Draba nivalis

Draba nivalis

Genome Assembly ID:t171823.G001

配列名:Dniv87_Chicago_SSPACE_LINKS14_1kb_ChromonomerRun4_integrated_20July2018

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Dniv87_Chicago_SSPACE_LINKS14_1kb_ChromonomerRun4_integrated_20July2018 系統名 accession 008-7
配列数 6,648 染色体数 NA
配列長 (bp) 301,641,952 N50長 (bp) 34,185,534
遺伝子の数 33,557 遺伝子数由来ファイル Dniva.Maker.Run5.all.proteins.NumberedGenes.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Oxford Nanopore, Chicago 取得した配列量 1.57 Gb(Chicago), 1.33 Gb(Oxford Nanopore)
アセンブリ方法 DISCOVAR de novo (release 52488) 推定ゲノムサイズ (Mb) 278.48(k-mer), 254_308(flow cytometry)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Used genetic map
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Michael D. Nowak (University of Oslo) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1111/1755-0998.13280 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット