配列名:Dniv87_Chicago_SSPACE_LINKS14_1kb_ChromonomerRun4_integrated_20July2018
ゲノム配列名 | Dniv87_Chicago_SSPACE_LINKS14_1kb_ChromonomerRun4_integrated_20July2018 | 系統名 | accession 008-7 |
配列数 | 6,648 | 染色体数 | NA |
配列長 (bp) | 301,641,952 | N50長 (bp) | 34,185,534 |
遺伝子の数 | 33,557 | 遺伝子数由来ファイル | Dniva.Maker.Run5.all.proteins.NumberedGenes.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, Oxford Nanopore, Chicago | 取得した配列量 | 1.57 Gb(Chicago), 1.33 Gb(Oxford Nanopore) |
アセンブリ方法 | DISCOVAR de novo (release 52488) | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 278.48(k-mer), 254_308(flow cytometry) |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Used genetic map |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Michael D. Nowak (University of Oslo) | データソース名 | DRYAD |
論文 (DOIコード) | 10.1111/1755-0998.13280 | データソースURL | https://datadryad.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |