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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Primula veris subsp. veris , Cowslip (ssp. Veris) , キバナノクリンザクラ (veris亜種)

Primula veris

Genome Assembly ID:t170927.G003

配列名:Primula_veris_paternal_haplotype

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Primula_veris_paternal_haplotype 系統名 ssp. veris, T78 (From the F1 population obtained by crossing female T2DB3 and male P20031402)
配列数 640 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 419,580,496 N50長 (bp) 34,354,822
遺伝子の数 34,008 遺伝子数由来ファイル pve_haplotypeP.longCDS.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Illumina 取得した配列量 114x (ONT), 63x (Illumina)
アセンブリ方法 Canu v.1.8 推定ゲノムサイズ (Mb) 452
シーケンシングの方法のコメント NA コメント The maternal and paternal nanopore data sets were assembled separately, resulting in two haploid assemblies.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Elena Conti (University of Zurich) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1093/molbev/msac035 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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