配列名:Primula_veris_paternal_haplotype
ゲノム配列名 | Primula_veris_paternal_haplotype | 系統名 | ssp. veris, T78 (From the F1 population obtained by crossing female T2DB3 and male P20031402) |
配列数 | 640 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 419,580,496 | N50長 (bp) | 34,354,822 |
遺伝子の数 | 34,008 | 遺伝子数由来ファイル | pve_haplotypeP.longCDS.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Oxford Nanopore, Illumina | 取得した配列量 | 114x (ONT), 63x (Illumina) |
アセンブリ方法 | Canu v.1.8 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 452 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | The maternal and paternal nanopore data sets were assembled separately, resulting in two haploid assemblies. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Elena Conti (University of Zurich) | データソース名 | Figshare |
論文 (DOIコード) | 10.1093/molbev/msac035 | データソースURL | https://figshare.com |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |