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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Buddleja alternifolia , Buddleja alternifolia , バタフライブッシュ

Buddleja alternifolia

Genome Assembly ID:t168488.G001

配列名:GCA_019426215.1_BAv1.1_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_019426215.1_BAv1.1_genomic 系統名 wild accession
配列数 439 染色体数 NA
配列長 (bp) 853,754,563 N50長 (bp) 43,104,400
遺伝子の数 29,434 遺伝子数由来ファイル GCA_019426215.1_BAv1.1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 29,434 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C 取得した配列量 100x(PacBio), 120x(Illumina), 170x(Hi-C)
アセンブリ方法 Smartdenovo v.1.0, Wtdbg v.1.2.8, Canu v.1.7 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Wei-Bang Sun (Chinese Academy of Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1111/nph.17637 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:90.8%,D:8.0%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.3%[S:86.4%,D:6.9%],F:3.1%,M:3.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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