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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Castanopsis hystrix , Castanopsis hystrix , クリガシ

Castanopsis hystrix

Genome Assembly ID:t167390.G001

配列名:GWHBWDD00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBWDD00000000 系統名 NA
配列数 172 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 882,694,700 N50長 (bp) 75,625,220
遺伝子の数 36,900 遺伝子数由来ファイル GWHBWDD00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 59x (Illumina), 31x (PacBIo), 160x (Hi-C)
アセンブリ方法 Hifiasm v0.15.4, ALLHiC, Juicebox 推定ゲノムサイズ (Mb) 898
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hanhan Xia (Zhongkai University of Agriculture and Engineering) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.3389/fpls.2023.1174972 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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