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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Actinidia rufa , Nashi-kazura , シマサルナシ

Actinidia rufa

Genome Assembly ID:t165716.G001

配列名:ARU_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ARU_r1.0 系統名 Nakamura-B-male
配列数 29 染色体数 2n = 2x = 58
配列長 (bp) 620,324,227 N50長 (bp) 21,198,568
遺伝子の数 63,947 遺伝子数由来ファイル ARU1.0.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 63,947 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takashi Akagi (Okayama University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-023-01361-9 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:67.1%,D:31.4%],F:0.6%,M:0.9%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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