配列名:ARU_r1.0
ゲノム配列名 | ARU_r1.0 | 系統名 | Nakamura-B-male |
配列数 | 29 | 染色体数 | 2n = 2x = 58 |
配列長 (bp) | 620,324,227 | N50長 (bp) | 21,198,568 |
遺伝子の数 | 63,947 | 遺伝子数由来ファイル | ARU1.0.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 63,947 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Hifi | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Takashi Akagi (Okayama University) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41477-023-01361-9 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.5%[S:67.1%,D:31.4%],F:0.6%,M:0.9%,n:2326 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | NA |