配列名:VPE_r1.0p
ゲノム配列名 | VPE_r1.0p | 系統名 | Sakai3 |
配列数 | 143 | 染色体数 | 2n = 6x = 52 |
配列長 (bp) | 822,655,281 | N50長 (bp) | 24,258,466 |
遺伝子の数 | 62,545 | 遺伝子数由来ファイル | VPE_r1.0p.HC.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Hifi | 取得した配列量 | 36.4x |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 899 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Tomoko Hirano (Kyoto Prefectural Univ) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | データソースURL | https://plantgarden.jp/ | |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |