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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Veronica peregrinait , Neckweed , ムシクサ

Veronica peregrinait

Genome Assembly ID:t165341.G001

配列名:VPE_r1.0p

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 VPE_r1.0p 系統名 Sakai3
配列数 143 染色体数 2n = 6x = 52
配列長 (bp) 822,655,281 N50長 (bp) 24,258,466
遺伝子の数 62,545 遺伝子数由来ファイル VPE_r1.0p.HC.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi 取得した配列量 36.4x
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 899
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Tomoko Hirano (Kyoto Prefectural Univ) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.0.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:18.8%,D:80.0%],F:0.3%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.6%[S:25.5%,D:71.1%],F:0.9%,M:2.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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