配列名:White_v1.0
ゲノム配列名 | White_v1.0 | 系統名 | cv. White |
配列数 | 30 | 染色体数 | 2n = 2x = 58 |
配列長 (bp) | 690,781,529 | N50長 (bp) | 23,583,865 |
遺伝子の数 | 42,988 | 遺伝子数由来ファイル | White_pep_v1.0.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 42,988 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel | 取得した配列量 | 52.5x |
アセンブリ方法 | Canu, wtdbg, Quickerge | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 745 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Zhangjun Fei (Cornell University), Yongsheng Liu (Anhui Agricultural University) | データソース名 | Kiwifruit Genome Database |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giz027 | データソースURL | http://kiwifruitgenome.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:95.8%[S:79.4%,D:16.4%],F:2.0%,M:2.2%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:83.4%[S:74.2%,D:9.2%],F:9.8%,M:6.8%,n:1614 |