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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Actinidia eriantha , Kiwifruit (eriantha) , キウイフルーツ (eriantha種)

Actinidia eriantha

Genome Assembly ID:t165200.G001

配列名:White_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 White_v1.0 系統名 cv. White
配列数 30 染色体数 2n = 2x = 58
配列長 (bp) 690,781,529 N50長 (bp) 23,583,865
遺伝子の数 42,988 遺伝子数由来ファイル White_pep_v1.0.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 42,988 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 52.5x
アセンブリ方法 Canu, wtdbg, Quickerge 推定ゲノムサイズ (Mb) 745
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhangjun Fei (Cornell University), Yongsheng Liu (Anhui Agricultural University) データソース名 Kiwifruit Genome Database
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giz027 データソースURL http://kiwifruitgenome.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:95.8%[S:79.4%,D:16.4%],F:2.0%,M:2.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:83.4%[S:74.2%,D:9.2%],F:9.8%,M:6.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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