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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Beta vulgaris subsp. vulgaris , Beet, Sugar beet. (ssp. Vulgaris) , テンサイ, フダンソウ, ビート (Vulgaris 亜種)

Beta vulgaris

Genome Assembly ID:t161934.G002

配列名:Bvulgaris_548_EL10_1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Bvulgaris_548_EL10_1.0 系統名 subsp. vulgaris, EL10
配列数 40 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 540,537,112 N50長 (bp) 57,938,902
遺伝子の数 24,255 遺伝子数由来ファイル Bvulgaris_548_EL10_1.0.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII, BioNano optical, Hi-C 取得した配列量 79.3x
アセンブリ方法 Falcon v0.2.2 推定ゲノムサイズ (Mb) 734
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kevin Dorn (USDA-ARS) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsac033 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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