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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Beta vulgaris subsp. vulgaris , Beet, Sugar beet. (ssp. Vulgaris) , テンサイ, フダンソウ, ビート (Vulgaris 亜種)

Beta vulgaris

Genome Assembly ID:t161934.G001

配列名:RefBeet-1.2.2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 RefBeet-1.2.2 系統名 subsp. vulgaris, KWS2320
配列数 40,245 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 566,181,630 N50長 (bp) 34,941,034
遺伝子の数 28,721 遺伝子数由来ファイル Beta_vulgaris.RefBeet-1.2.2.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 28,721 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454, Sanger 取得した配列量 30x
アセンブリ方法 Newbler v. 2.6 推定ゲノムサイズ (Mb) 731
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Heinz Himmelbauer (Max Planck Institute for Molecular Genetics), Bernd Weisshaar (Bielefeld University) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/nature12817:10.1186/s13059-015-0729-7 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:97.8%,D:0.9%],F:0.5%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.6%[S:88.4%,D:9.2%],F:1.2%,M:1.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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