配列名:RefBeet-1.2.2
ゲノム配列名 | RefBeet-1.2.2 | 系統名 | subsp. vulgaris, KWS2320 |
配列数 | 40,245 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 566,181,630 | N50長 (bp) | 34,941,034 |
遺伝子の数 | 28,721 | 遺伝子数由来ファイル | Beta_vulgaris.RefBeet-1.2.2.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 28,721 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454, Sanger | 取得した配列量 | 30x |
アセンブリ方法 | Newbler v. 2.6 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 731 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Heinz Himmelbauer (Max Planck Institute for Molecular Genetics), Bernd Weisshaar (Bielefeld University) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature12817:10.1186/s13059-015-0729-7 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.7%[S:97.8%,D:0.9%],F:0.5%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:97.6%[S:88.4%,D:9.2%],F:1.2%,M:1.2%,n:1614 |