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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Aristolochia fimbriata , white-veined Dutchman's pipe , アリストロキア・フィンブリアタ

Aristolochia fimbriata

Genome Assembly ID:t158543.G001

配列名:GWHBEBS00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBEBS00000000 系統名 NA
配列数 232 染色体数 NA
配列長 (bp) 257,701,785 N50長 (bp) 33,250,414
遺伝子の数 21,751 遺伝子数由来ファイル GWHBEBS00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 21,751 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore 取得した配列量 120x
アセンブリ方法 minimap2 v.2.15-r914, miniasm v.0.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 290
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yuannian Jiao (Chinese Academy of Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/S41477-021-00990-2 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.1%[S:96.3%,D:1.8%],F:1.1%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.4%[S:94.1%,D:2.3%],F:1.4%,M:2.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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