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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ophiorrhiza pumila , Ophiorrhiza pumila , チャボイナモリ

Ophiorrhiza pumila

Genome Assembly ID:t157934.G001

配列名:Opu_r1.4

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Opu_r1.4 系統名 NA
配列数 13 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 440,319,191 N50長 (bp) 40,565,736
遺伝子の数 32,389 遺伝子数由来ファイル Opu_r1.4_pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 32,389 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Bionano, Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Canu v.1.7, Falcon-unzip v.1.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 420
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Amit Rai (Chiba University), Mami Yamazaki (ditto) データソース名 Ophiorrhiza pumila Genome DataBase
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-020-20508-2 データソースURL http://pumila.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.0%[S:95.5%,D:2.5%],F:0.8%,M:1.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:89.2%[S:86.6%,D:2.6%],F:3.7%,M:7.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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