配列名:Vradiata_ver6
ゲノム配列名 | Vradiata_ver6 | 系統名 | var. radiata, line VC1973A |
配列数 | 2,497 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 463,085,359 | N50長 (bp) | 25,360,630 |
遺伝子の数 | 23,181 | 遺伝子数由来ファイル | Vigna_radiata.Vradiata_ver6.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 23,181 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 300.0x |
アセンブリ方法 | Allpath-LG v. 42179 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 548 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | The line VC1973A which was developed at the AVRDC-The World Vegetable Center in 1982. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Rajeev K. Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics), Suk-Ha Lee (Seoul National University) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ncomms6443 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.2%[S:95.4%,D:2.8%],F:1.0%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:82.5%[S:77.3%,D:5.2%],F:10.7%,M:6.8%,n:1614 |