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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Dendrobium huoshanense , Dendrobium huoshanense , デンドロビウム (huoshanense種), デンドロビューム

Dendrobium huoshanense

Genome Assembly ID:t154293.G001

配列名:D.huoshanense.v20200604.chromosome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 D.huoshanense.v20200604.chromosome 系統名 wild accession
配列数 2,252 染色体数 NA
配列長 (bp) 1,285,413,095 N50長 (bp) 71,787,958
遺伝子の数 21,070 遺伝子数由来ファイル D.huoshanense.v20200604.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C 取得した配列量 105x(Illumina), 108x(PacBio), 139x(Hi-C)
アセンブリ方法 smartdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,290
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Naifu Chen (West Anhui University) データソース名 CNGBdb
論文 (DOIコード) 10.1093/gbe/evaa215 データソースURL https://db.cngb.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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