配列名:Bdistachyon_314_v3.0
ゲノム配列名 | Bdistachyon_314_v3.0 | 系統名 | Bd21 |
配列数 | 10 | 染色体数 | 2n = 2x = 10 |
配列長 (bp) | 271,163,419 | N50長 (bp) | 59,130,575 |
遺伝子の数 | 52,972 | 遺伝子数由来ファイル | Bdistachyon_314_v3.1.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 52,972 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | ABI 3739 | 取得した配列量 | 9.43x |
アセンブリ方法 | ARACHNE v. 20071016_modified | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 272 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | The International Brachypodium Initiative, John P. Vogel (USDA-ARS Western Regional Research Center), David F. Garvin (USDA-ARS Plant Science Research Unit and University of Minnesota), Todd C. Mockler (Oregon State University), Michael W. Bevan (John Innes Centre) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature08747 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.6%[S:97.5%,D:1.1%],F:0.7%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.3%[S:62.3%,D:37.0%],F:0.3%,M:0.4%,n:1614 |