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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brachypodium distachyon , Purple falsebrome , セイヨウヤマカモジ

Brachypodium distachyon

Genome Assembly ID:t15368.G001

配列名:Bdistachyon_314_v3.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Bdistachyon_314_v3.0 系統名 Bd21
配列数 10 染色体数 2n = 2x = 10
配列長 (bp) 271,163,419 N50長 (bp) 59,130,575
遺伝子の数 52,972 遺伝子数由来ファイル Bdistachyon_314_v3.1.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 52,972 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 ABI 3739 取得した配列量 9.43x
アセンブリ方法 ARACHNE v. 20071016_modified 推定ゲノムサイズ (Mb) 272
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 The International Brachypodium Initiative, John P. Vogel (USDA-ARS Western Regional Research Center), David F. Garvin (USDA-ARS Plant Science Research Unit and University of Minnesota), Todd C. Mockler (Oregon State University), Michael W. Bevan (John Innes Centre) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/nature08747 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.6%[S:97.5%,D:1.1%],F:0.7%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.3%[S:62.3%,D:37.0%],F:0.3%,M:0.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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