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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Malpighia emarginata , Acerola , アセロラ

Malpighia emarginata

Genome Assembly ID:t151847.G001

配列名:NRA309

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 NRA309 系統名 NRA309
配列数 61 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 1,052,961,072 N50長 (bp) 104,183,651
遺伝子の数 35,892 遺伝子数由来ファイル NRA309.pmol.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 35,892 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi genetic mapping 取得した配列量 24.6x
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,114
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2024.07.30.605750 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.5.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:95.6%,D:3.2%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.1%[S:95.8%,D:3.3%],F:0.7%,M:0.2%,n:1614

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染色体 /
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fasta
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