配列名:NRA309
ゲノム配列名 | NRA309 | 系統名 | NRA309 |
配列数 | 61 | 染色体数 | 2n = 2x = 20 |
配列長 (bp) | 1,052,961,072 | N50長 (bp) | 104,183,651 |
遺伝子の数 | 35,892 | 遺伝子数由来ファイル | NRA309.pmol.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 35,892 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Hifi genetic mapping | 取得した配列量 | 24.6x |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,114 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2024.07.30.605750 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.5.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:95.6%,D:3.2%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.1%[S:95.8%,D:3.3%],F:0.7%,M:0.2%,n:1614 |