Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus fruticosa , European dwarf cherry , グランドチェリー, グラウンドチェリー

Prunus fruticosa

Genome Assembly ID:t151433.G001

配列名:JKI_Pf_1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 JKI_Pf_1.0 系統名 NA
配列数 57 染色体数 2n = 4x = 32
配列長 (bp) 375,294,239 N50長 (bp) 43,818,497
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore 取得した配列量 97x
アセンブリ方法 Minimap2 (2.16-r922), Miniasm (0.2-r137-dirty), Racon (v1.4.10), Medaka (1.01), Purge Dups (V1.0.1) 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Thomas W. W_hner (Julius Kuehn Institute) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1016/j.ygeno.2021.11.002 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット