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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus mira , Smoothpit peach , モモ

Prunus mira

Genome Assembly ID:t151332.G002

配列名:pmira_v2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 pmira_v2.0 系統名 wild accessions 2010-138
配列数 372 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 253,628,689 N50長 (bp) 27,933,902
遺伝子の数 28,519 遺伝子数由来ファイル Pmi.update.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 600.37x
アセンブリ方法 Hifiasm v0.13-r308, ALLHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 243
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Lirong Wang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1186/s12915-022-01342-y データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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