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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Litchi chinensis , Lychee , レイシ, ライチ

Litchi chinensis

Genome Assembly ID:t151069.G001

配列名:Lchinesis_genome.Chr

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Lchinesis_genome.Chr 系統名 Feizixiao
配列数 15 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 470,368,600 N50長 (bp) 30,902,938
遺伝子の数 59,630 遺伝子数由来ファイル Lchinesis_genome.Chr.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C 取得した配列量 124x(PacBio), 184x(Illumina), 144x(Hi-C)
アセンブリ方法 Canu (v.1.6) 推定ゲノムサイズ (Mb) 500(flow cytometory), 460(k-mer)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jianguo Li (South China Agricultural University) データソース名 Mendeley
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-021-00971-3 データソースURL https://data.mendeley.com/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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