Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Calamus jenkinsiana , Ginseng rattan , トウ

Calamus jenkinsiana

Genome Assembly ID:t1510057.G001

配列名:D.jenkinsiana.genome.WGS

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 D.jenkinsiana.genome.WGS 系統名 NA
配列数 4,398 染色体数 NA
配列長 (bp) 1,608,994,761 N50長 (bp) 784,425
遺伝子の数 53,342 遺伝子数由来ファイル D.jenkinsiana.coding.gene.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio Sequel, Hi-C 取得した配列量 266x
アセンブリ方法 Platanus v1.2.4, DBG2OLC 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,610
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Hybrid de novo genome assembly
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zehui Jiang (International Center for Bamboo and Rattan) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giy097 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット