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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ceratotheca sesamoides , False sesame, Wild sesame , ニセゴマ, 野生ゴマ, ゴマ野生種 (Ceratotheca sesamoides種)

Ceratotheca sesamoides

Genome Assembly ID:t1503106.G001

配列名:Cses_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cses_v1.0 系統名 COL/GHANA/1993/MAFF/GJ93/233
配列数 168 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 362,098,866 N50長 (bp) 20,622,006
遺伝子の数 24,170 遺伝子数由来ファイル C.sesamoides_hic_annotation_v1.0_protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina PE, PacBio CLR, Hi-C 取得した配列量 455x
アセンブリ方法 Canu v2.1.1; Arrow (gcpp 1.0.0-SL-release-8.0.0); Pilon v1.24; YaHS v1.2a.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 367
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Masayuki Yamamoto (Toyama University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.4.3 BUSCO データセット eudicots_odb10
BUSCO ゲノム C:98.3%[S:92.5%,D:5.8%],F:0.6%,M:1.1%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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