Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gillenia trifoliata , Bowman's root, Indian-physic, American ipecac , ミツバシモツケ, ギレニア・トリフォリアタ

Gillenia trifoliata

Genome Assembly ID:t141003.G001

配列名:Gtrifoliata_genome_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Gtrifoliata_genome_v1.0 系統名 NA
配列数 1,262 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 296,303,550 N50長 (bp) 29,393,837
遺伝子の数 30,259 遺伝子数由来ファイル Gtr.NCBI.prot.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 109X
アセンブリ方法 Supernova(v1.2.2) 推定ゲノムサイズ (Mb) 321.6_
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 David Chagne (University of Otago) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1038/s41438-021-00662-4 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット