Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus tenella , Wild almond , Prunus tenella

Prunus tenella

Genome Assembly ID:t140661.G001

配列名:GWHCBGA00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHCBGA00000000.genome 系統名 wild accession
配列数 479 染色体数 n = 8
配列長 (bp) 231,208,648 N50長 (bp) 25,637,364
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Hi-C, PacBio 取得した配列量 137.00x(Illumina), 34.6 GB(PacBio), 36.05 Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 hifiasm (v0.14-r312) 推定ゲノムサイズ (Mb) 216
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhaoshan Wang (Chinese Academy of Forestry) データソース名 Genome warehouse
論文 (DOIコード) 10.20944/preprints202305.1095.v1 データソースURL https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット