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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Triadica sebifera , Chinese tallow tree , ナンキンハゼ

Triadica sebifera

Genome Assembly ID:t139772.G001

配列名:GCA_023653625.1_ASM2365362v1_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_023653625.1_ASM2365362v1_genomic 系統名 wild accession
配列数 25 染色体数 NA
配列長 (bp) 739,397,770 N50長 (bp) 34,174,058
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Iso-seq, PacBio, Hi-C 取得した配列量 42.81_Gb(PacBio), 127.09_Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 Canu (Canu v2.1.1) and Hifiasm (HifiAsm-0.16.1) 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,950
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Nian Wang (Huazhong Agricultural University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s42003-022-03751-9 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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