配列名:GCA_015143295.1_ASM1514329v1_genomic
ゲノム配列名 | GCA_015143295.1_ASM1514329v1_genomic | 系統名 | wild accession |
配列数 | 1,485 | 染色体数 | 2n = 48 |
配列長 (bp) | 1,161,357,243 | N50長 (bp) | 45,450,728 |
遺伝子の数 | 32,739 | 遺伝子数由来ファイル | GCA_015143295.1_ASM1514329v1_protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, Hi-C | 取得した配列量 | 100x(PacBio), 82 Gb(Illumina) |
アセンブリ方法 | SMARTdenovo (v 0.2), or WTDBG2 after CANU correction (v0.6) | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,120 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jinxing Lin (Beijing Forestry University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s13059-020-02198-7 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |