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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Tetracentron sinense , Tetracentron sinense , スイセイジュ

Tetracentron sinense

Genome Assembly ID:t13715.G001

配列名:GCA_015143295.1_ASM1514329v1_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_015143295.1_ASM1514329v1_genomic 系統名 wild accession
配列数 1,485 染色体数 2n = 48
配列長 (bp) 1,161,357,243 N50長 (bp) 45,450,728
遺伝子の数 32,739 遺伝子数由来ファイル GCA_015143295.1_ASM1514329v1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 100x(PacBio), 82 Gb(Illumina)
アセンブリ方法 SMARTdenovo (v 0.2), or WTDBG2 after CANU correction (v0.6) 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,120
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jinxing Lin (Beijing Forestry University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1186/s13059-020-02198-7 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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