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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Dendrobium hybrid cultivar , Orchid , デンドロビウム交雑種

Dendrobium hybrid cultivar

Genome Assembly ID:t136990.G001

配列名:Dendrobium_mutant

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Dendrobium_mutant 系統名 cv. Emma White, early flowering gamma mutant
配列数 549,354 染色体数 2n = 2x = 38
配列長 (bp) 687,254,899 N50長 (bp) 1,762
遺伝子の数 96,522 遺伝子数由来ファイル NGS_P6657_Dendrobium_mutatnt_Predicted_proteins.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 17x
アセンブリ方法 MaSuRCA v.4.0.3 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ramgopal Devadas (ICAR-National Research Centre on Orchids) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.46471/gigabyte.66 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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