配列名:Cara_1.0
ゲノム配列名 | Cara_1.0 | 系統名 | cv. Caturra red, isolate CCC135-36 |
配列数 | 2,833 | 染色体数 | 2n = 4x = 44 |
配列長 (bp) | 1,094,446,607 | N50長 (bp) | 42,465,768 |
遺伝子の数 | 67,222 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_003713225.1_Cara_1.0_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 67,222 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, 10X | 取得した配列量 | 160.0x |
アセンブリ方法 | MaSuRCA v. 3.2.4; FALCON-Unzip v. 0.9 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,300 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | cv. Caturra red, isolate CCC135-36 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | NA | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | Direct submission | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.4%[S:37.2%,D:60.2%],F:0.9%,M:1.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.2%[S:18.0%,D:80.2%],F:0.6%,M:1.2%,n:1614 |