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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Amphicarpaea edgeworthii , Amphicarpaea edgeworthii , ヤブマメ

Amphicarpaea edgeworthii

Genome Assembly ID:t132429.G001

配列名:Amed

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Amed 系統名 wild accession
配列数 24 染色体数 2n = 22
配列長 (bp) 299,059,313 N50長 (bp) 27,224,559
遺伝子の数 27,899 遺伝子数由来ファイル Amed.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 DNBseq, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 77.12 Gb(DNBseq), 174.27x(Oxford Nanopore), 208.27 million(Hi-C)
アセンブリ方法 SMARTdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) 320
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shubo Wan (Shandong Academy of Agricultural Sciences) データソース名 CNSA
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.13520 データソースURL https://db.cngb.org/cnsa/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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