配列名:Amed
ゲノム配列名 | Amed | 系統名 | wild accession |
配列数 | 24 | 染色体数 | 2n = 22 |
配列長 (bp) | 299,059,313 | N50長 (bp) | 27,224,559 |
遺伝子の数 | 27,899 | 遺伝子数由来ファイル | Amed.pep.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | DNBseq, Oxford Nanopore, Hi-C | 取得した配列量 | 77.12 Gb(DNBseq), 174.27x(Oxford Nanopore), 208.27 million(Hi-C) |
アセンブリ方法 | SMARTdenovo | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 320 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Shubo Wan (Shandong Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | CNSA |
論文 (DOIコード) | 10.1111/pbi.13520 | データソースURL | https://db.cngb.org/cnsa/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |