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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cuscuta campestris , Field dodder, Golden dodder, Large-seeded alfalfa dodder, Yellow dodder, Prairie dodder , アメリカネナシカズラ

Cuscuta campestris

Genome Assembly ID:t132261.G002

配列名:cucam_0.32

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 cucam_0.32 系統名 NA
配列数 6,907 染色体数 2n = 4x = 60
配列長 (bp) 476,794,675 N50長 (bp) 1,384,808
遺伝子の数 53,203 遺伝子数由来ファイル cucam_0.32.annot.protein.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 IIlumina, PacBio 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 DISCOVAR de novo r52488, SSPACE-Standard v3.0, SSPACE-Longread v1.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 581
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kirsten Krause (UiT The Arctic University of Norway) データソース名 plaBi database
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-018-04344-z データソースURL http://plabipd.de/portal/cuscuta-campestris
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:89.5%[S:13.0%,D:76.5%],F:1.0%,M:9.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:83.3%[S:16.8%,D:66.5%],F:6.1%,M:10.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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