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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cuscuta campestris , Field dodder, Golden dodder, Large-seeded alfalfa dodder, Yellow dodder, Prairie dodder , アメリカネナシカズラ

Cuscuta campestris

Genome Assembly ID:t132261.G001

配列名:Ccam_Kyo_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Ccam_Kyo_v1.0 系統名 Kyotanga
配列数 99 染色体数 2n = 4x = 60
配列長 (bp) 514,933,710 N50長 (bp) 15,868,621
遺伝子の数 37,546 遺伝子数由来ファイル Cuscuta_campestris_Kyotango.pep.v1.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 37,546 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio HiFi 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 514
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Tenta Segawa (Suntory Global Innovation Center Ltd.) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1093/pcp/pcag002 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット eudicots_odb10
BUSCO ゲノム C:86.4%[S:3.1%,D:83.3%],F:0.9%,M:12.7%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:86.7%[S:3.6%,D:83.1%],F:0.6%,M:12.7%,n:2326

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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