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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Arachis ipaensis , Wild peanut (ipaensis) , ラッカセイ野生種 (ipaensis種)

Arachis ipaensis

Genome Assembly ID:t130454.G001

配列名:K30076.gnm1.bXJ8

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 K30076.gnm1.bXJ8 系統名 K30076
配列数 552 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 1,353,826,449 N50長 (bp) 136,175,642
遺伝子の数 41,840 遺伝子数由来ファイル araip.K30076.gnm1.ann1.J37m.protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 41,840 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 100x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.04 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,560
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 David John Bertioli (University of Brasilia) データソース名 PeanutBase
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.3517 データソースURL https://peanutbase.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.2%[S:88.5%,D:8.7%],F:1.3%,M:1.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:85.5%[S:78.6%,D:6.9%],F:5.8%,M:8.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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