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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Arachis duranensis , Wild peanut (duranensis) , ラッカセイ野生種 (duranensis種)

Arachis duranensis

Genome Assembly ID:t130453.G001

配列名:V14167.gnm1.SWBf

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 V14167.gnm1.SWBf 系統名 V14167
配列数 1,507 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 1,084,261,490 N50長 (bp) 110,037,037
遺伝子の数 36,734 遺伝子数由来ファイル aradu.V14167.gnm1.ann1.cxSM.protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 36,734 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 100x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.04 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,250
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 David John Bertioli (University of Brasilia) データソース名 PeanutBase
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.3517 データソースURL https://peanutbase.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.1%[S:90.0%,D:8.1%],F:1.2%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:87.9%[S:80.9%,D:7.0%],F:3.8%,M:8.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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