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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Galdieria sulphuraria , Red algae , イデユコゴメ

Galdieria sulphuraria

Genome Assembly ID:t130081.G002

配列名:NCBI_GASU_GCA_026122205.1_ASM2612220v1_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 NCBI_GASU_GCA_026122205.1_ASM2612220v1_genomic 系統名 Strain 108.79 E11
配列数 76 染色体数 2n = 4
配列長 (bp) 14,511,588 N50長 (bp) 191,579
遺伝子の数 7,020 遺伝子数由来ファイル GASU_108.79_E11_76ctgs_211230_7020proteins.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RS II, Oxford Nanopore, Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 FALCON v0.3.0, CANU v2.2, HGAP3, MaSuRCA v3.2.4 推定ゲノムサイズ (Mb) 15
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Hybrid assembly
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hwan Su Yoon (Sungkyunkwan University) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-022-35566-x データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:10.5%[S:9.0%,D:1.5%],F:1.3%,M:88.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:14.3%[S:11.8%,D:2.5%],F:1.4%,M:84.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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