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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Saccharum hybrid cultivar , Sugarcane , サトウキビ

Saccharum hybrid cultivar

Genome Assembly ID:t128810.G001

配列名:sc.mlc.cns.sgl.utg.scga7

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 sc.mlc.cns.sgl.utg.scga7 系統名 cv. SP80-3280
配列数 450,609 染色体数 NA
配列長 (bp) 4,259,506,050 N50長 (bp) 13,157
遺伝子の数 374,774 遺伝子数由来ファイル sc.mlc.cns.sgl.utg.scga7.predicted_protein.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454 取得した配列量 1.9x (Illumina), 0.66x (454)
アセンブリ方法 Celera, Phrap 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント The authers assembled BACs individually using Phrap as described 10.1186/1471-2164-15-540.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Glaucia Mendes Souza (University of Sao Paulo) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giz129 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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