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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Acorus tatarinowii , Sweetflag , セキショウ

Acorus tatarinowii

Genome Assembly ID:t123564.G001

配列名:GWHBECT00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBECT00000000.genome 系統名 wild accession
配列数 358 染色体数 2n = 24
配列長 (bp) 415,556,927 N50長 (bp) 33,598,074
遺伝子の数 28,235 遺伝子数由来ファイル ata.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 110.07_Gb(PacBio), 43Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 Canu v.2.2 推定ゲノムサイズ (Mb) 470
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Qingfeng Wang (Chinese Academy of Sciences) データソース名 China National GeneBank
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-022-01187-x データソースURL https://db.cngb.org/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:95.2%[S:86.5%,D:8.7%],F:1.6%,M:3.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.7%[S:86.8%,D:7.9%],F:1.2%,M:4.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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